专注基因技术

表观遗传学

表观基因组包括对基因组物理机构有决定作用的化学变化。它控制了基因表达,借此在整个细胞生命周期的不同时期选择激活哪些基因。表观遗传学在生长、发育和疾病发展阶段都发挥着重要的作用。表观遗传的变化体现了饮食、压力和其他环境因素的反映。
Illumina开发了多种基于测序和基于芯片的表观遗传分析工具,可为专研于表观遗传修饰及其对基因调控之影响的研究人员提供功能强大、简单易用且经济高效的解决方案。Illumina与顶尖表观基因组学专家展开合作,以确保其所提供的解决方案能够满足该领域内快速发展的需求。

甲基化测序
胞嘧啶甲基化可能明显改变基因的时空表达和染色质重塑。全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)利用新一代测序(NGS)和全基因组分析的力量,提供整个基因组甲基化模式的单碱基分辨率全面视图。
甲基化测序可发现整个基因组中所有CpG、CHH和CHG区域的甲基化模式,能以少量的DNA捕获全面的样品多样性,能查看大多数物种基因组中几乎每个胞嘧啶的甲基化。

主要研究方案

> TruSeq DNA Methylation Kit

全基因组亚硫酸氢盐测序,只需50-100 ng DNA。

更多详情:http://www.illumina.com/products/by-type/sequencing-kits/library-prep-kits/truseq-dna-methylation.html

甲基化芯片
DNA甲基化对基因表达调控起着动态的重要作用。借助MethylationEPIC BeadChip,研究人员可以基于单核苷酸分辨率定量检测基因组中的850,000多个甲基化位点,包括FFPE在内的多重样本可以并行分析,以便在每样本最低成本的情况下实现高通量功能。
依托业界领先的Infinium实验分析方法,MethylationEPIC BeadChip是全表观基因组关联研究(EWAS)的理想之选。它提供了由专家精选的全面的覆盖范围,囊括99%的RefSeq基因,95%的CpG岛,高覆盖度的增强子区域和其他内容类别。由于超过90%的Infinium HumanMethylation450K位点内容都涵盖在内,因此新一代MethylationEPIC试剂盒对这些位点也完全支持。

主要研究方案

> Infinium MethylationEPIC Kit

检测850,000多个甲基化位点,支持FFPE样品。

更多详情:http://www.illumina.com/products/by-type/microarray-kits/infinium-methylation-epic.html

DNA与蛋白的相互作用分析
通过染色质免疫沉淀(ChIP)检测和测序技术相结合,ChIP测序(ChIP-Seq)成为鉴定转录因子及其他蛋白因子在全基因组范围内的DNA结合位点的强有力方法。在ChIP操作之后,通过特异抗体将DNA结合蛋白免疫沉淀。结合的DNA被同时沉淀、纯化并测序。
新一代测序(NGS)在ChIP上的应用已经揭示了一些在各种疾病和生物学通路(如发育和癌症发展)中发挥作用的基因调控事件的线索。ChIP-Seq能够在全基因组规模上实现对蛋白与核酸相互作用的全面检测。
ChIP-Seq可在任何生物体的整个基因组中捕获转录因子或组蛋白修饰的DNA靶点,确定转录因子的结合位点,结合RNA测序和甲基化分析,揭示基因调控网络,并可兼容不同起始量的DNA样品。

主要研究方案

> TruSeq DNA Methylation Kit

全基因组亚硫酸氢盐测序,只需50-100 ng DNA。

更多详情:http://www.illumina.com/products/by-type/sequencing-kits/library-prep-kits/truseq-dna-methylation.html

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